去南疆胡杨林选择自由行还是跟团，需根据个人需求、经验和偏好来决定，以下是两者的优缺点分析，供你参考：
跟团游
优点：
省心省力：行程由旅行社规划，交通、住宿、门票等安排妥当，无需自己操心，尤其适合初次前往南疆、对当地情况不熟悉或不想花费大量时间做攻略的游客。
资源保障：旅行社与酒店、景区等有合作，在旺季能锁定住宿和门票，避免因订不到房或买不到票而影响行程。
安全保障：对于独库公路、塔克拉玛干沙漠等路况复杂或存在一定风险的路段，跟团游有专业导游和司机，安全性更高。
文化体验：专业导游可深入讲解当地的民俗文化、历史背景等，让游客更好地了解南疆。
缺点：
行程固定：游客需按照旅行社的安排行动，自由活动时间较少，可能无法深入体验自己感兴趣的地方。
可能存在购物环节：部分旅行团可能会安排购物点，影响游玩体验（但正规纯玩团会避免这种情况）。
自由行
优点：
灵活自由：可根据自己的兴趣和时间安排行程，比如在喜欢的景点停留更长时间，或临时改变行程去探索一些小众景点。
深度体验：能更自由地品尝当地美食，深入体验当地的生活氛围，与当地人交流互动。
拍照自由：对于摄影爱好者来说，自由行可以在最佳光线时段守在最佳机位，不用被团队的时间表催着走。
缺点：
规划繁琐：南疆地域广阔，景点之间距离较远，交通不便，自由行需要自己规划路线、预订交通和住宿，比较费时费力。
资源紧张：在旺季，自由行可能面临住宿、交通资源紧张的问题，价格也可能上涨。
安全风险：南疆部分地区路况复杂，对于自驾游客的驾驶技术和路况熟悉程度要求较高，存在一定的安全风险。
建议：
如果你是初次前往南疆、对当地情况不熟悉，或者是家庭出游、中老年群体，跟团游可能是更好的选择，能省心省力且有安全保障。
如果你有丰富的旅行经验和自驾经验，追求个性化的旅行体验，并且愿意花费时间和精力来规划行程，那么自由行可能更适合你，能更自由地探索南疆的美景和文化。